Por meio de parcerias com instituições de ensino públicas, como a Unesp de São José do Rio Preto (SP) e de Araçatuba (SP) e a Faculdade de Medicina de Rio Preto (Famerp), a Faperp oferece cursos de Pós-Graduação Lato Sensu e Extensão, tendo como objetivo a formação de recursos humanos e o aprimoramento de conhecimento em setores específicos de atividades acadêmicas e profissionais.